每種藥物都有副作用，正所謂是藥三分毒。抑郁癥的治療一般選用中藥，因為抑郁癥常常都是長期治療的。對于治療抑郁癥的舍曲林來說也是一樣。然而舍曲林副作用少，用于治療抑郁癥是臨床的主要治療措施。

鹽酸舍曲林片抑郁癥，亦可用于治療強迫癥。鹽酸舍曲林片能有效地減輕病人的抑郁癥狀，包括煩躁情緒，并能減輕持續性的疲勞癥狀以及焦慮狀態，在治療抑郁癥和焦慮障礙方面，療效顯著，安全性好，耐受性強，是當前治療抑郁、焦慮障礙時首選藥物之一。

鹽酸舍曲林片服藥7天左右可見療效，完全的療效而在服藥的第2至4周才顯現，強迫癥療效的出現則可能需要更長時間。鹽酸舍曲林片長期用藥應根據療效調整劑量，并維持在最低的有效治療劑量。鹽酸舍曲林片與單胺氧化酶抑制劑合用，可出現嚴重反應，在停用單胺氧化酶抑制劑14天內，不能服用本藥;停用本品后也需14天以上才能開始單胺氧化酶抑制劑的治療。

鹽酸舍曲林片可有胃腸道不適，如惡心、厭食、腹瀉等副作用。亦可出現頭痛、不安、無力、嗜睡、失眠、頭暈或震顫等。少見不良反應有過敏性皮疹及性功能減退。大劑量時可能誘發癲癇。突然停藥可有撤藥綜合癥，如失眠、焦慮、惡心、出汗、震顫、眩暈或感覺異常等。

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